रोड़ आनुवंशिकी

रोड़ आनुवंशिकी वास्तव में क्या दिखाती है

नमूने में कांस्य युग के स्टेपी पशुपालक वंश का दक्षिण एशिया के सबसे स्पष्ट दर्ज संकेतों में से एक मिला। मुख्य प्रकाशित मॉडल में रोड़ 22 बहु व्यक्ति आधुनिक समूह अनुमानों में पहले स्थान पर रहा।

मुख्य मॉडल62.1%

Steppe_MLBA संबंधित वंश। अगले समूह से 6.8 प्रतिशत अंक आगे।

Pathak et al. 2018 ↗
1st22 बहु व्यक्ति आधुनिक समूह अनुमानों में
+6.8अगले समूह पर प्रतिशत अंक की बढ़त
R=.91यूरोपीय स्टेपी वंश और रोड़ IBD साझेदारी का संबंध
15रोड़ जीनोटाइप किए गए। अधिकतर ऑटोसोमल जांच में 14
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स्टेपी का अर्थ

यह एक समय, स्थान और जन प्रवास है

Steppe_MLBA किसी एक जीन या क्षमता का स्कोर नहीं है। यह मध्य और उत्तर कांस्य युग के उन पशुपालक समूहों से जुड़ा वंश संकेत है जो यूरेशियाई घास के मैदानों से मध्य एशिया और फिर दक्षिण एशिया तक पहुंचे। रोड़ के लिए इसका महत्व ऐतिहासिक है। नमूना इस बड़े प्रवास का असामान्य रूप से मजबूत रिकॉर्ड रखता है।

यमनाया विस्तार

काला सागर और कैस्पियन सागर के उत्तर के मैदानों से पशुपालक वंश फैला।

MLBA समूह

सिंताष्टा, पेत्रोव्का और श्रुबनाया संबंधित समूह मध्य एशिया की ओर बढ़े।

दक्षिण एशिया में प्रवेश

प्राचीन डीएनए इस वंश धारा को दूसरी सहस्राब्दी ईसा पूर्व के पहले भाग में दक्षिण की ओर दिखाता है।

रोड़ नमूना

कई आनुवंशिक जांचों में यह कांस्य युग संकेत दक्षिण एशियाई तुलना के ऊपरी सिरे पर मिला।

MLBA

कौन से लोग

मध्य और उत्तर कांस्य युग के स्टेपी समूह। ये पहले के यमनाया संबंधित वंश और यूरोपीय कृषक संबंधित वंश के मिश्रण से बने थे।

ANI

रोड़ क्यों महत्वपूर्ण

लेख में कलाश का कुल ANI अधिक हो सकने की बात कही गई है। कम आनुवंशिक ड्रिफ्ट और विशिष्ट MLBA संकेत के कारण रोड़ को ANI मॉडलिंग के लिए उपयोगी वैकल्पिक वर्तमान प्रतिनिधि बताया गया।

Ror

असली बढ़त

साक्ष्य रोड़ को उत्तर पश्चिम भारत के जन इतिहास का असाधारण रूप से स्पष्ट आनुवंशिक रिकॉर्ड बनाता है। यही मजबूत और प्रमाणित दावा है।

दक्षिण और मध्य एशिया का प्राचीन डीएनए अध्ययन ↗

सीधी रैंकिंग

रोड़ (हरियाणा) बहु व्यक्ति तुलना में पहले स्थान पर

मुख्य तीन स्रोत qpAdm मॉडल में रोड़ (हरियाणा) 62.1 प्रतिशत पर 22 बहु व्यक्ति आधुनिक समूहों में पहले स्थान पर था। खत्री 55.3 प्रतिशत और पठान 54.7 प्रतिशत पर अगले दो समूह थे।

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22 में से 10 बहु व्यक्ति आधुनिक समूहों के प्रकाशित Steppe_MLBA संबंधित वंश अनुमान
समूहस्थानअनुमानमानक त्रुटिनमूनामॉडल p
रोड़ (हरियाणा)162.1%±2.4n = 150.296
खत्री255.3%±2.5n = 190.090
पठान354.7%±2.4n = 220.334
ब्राह्मण, उत्तर प्रदेश451.0%±3.1n = 90.221
गुज्जर549.2%±2.8n = 150.266
ब्राह्मण, गुजरात648.9%±2.5n = 200.148
कंबोज748.5%±2.7n = 140.125
क्षत्रिय846.4%±3.1n = 70.173
धरकार946.3%±3.0n = 110.534
गुजराती1044.3%±2.6n = 1000.091
+6.8

खत्री की तुलना में प्रतिशत अंक की बढ़त। रोड़ (हरियाणा) 62.1%, खत्री 55.3%।

स्रोत: Pathak et al. 2018, Document S1, Table S11। पट्टियों में केवल एक से अधिक व्यक्तियों वाले आधुनिक समूह शामिल हैं।

62.1 प्रतिशत के अंदर

तीन प्राचीन वंश धाराएं, एक रोड़ मॉडल

qpAdm चुने गए प्राचीन संदर्भों के मिश्रण से रोड़ के allele sharing pattern को दोहराने की कोशिश करता है। ये संदर्भ सांख्यिकीय प्रतिनिधि हैं, सीधे पूर्वजों की सूची नहीं। किसी हिस्से पर क्लिक करके उसका अर्थ पढ़ें।

मध्य और उत्तर कांस्य युग62.1%

कांस्य युग स्टेपी

यूरेशियाई घास के मैदानों से मध्य एशिया होते हुए दक्षिण एशिया तक पहुंचे पशुपालक समूहों से जुड़ा वंश। नरसिम्हन और साथियों ने Central Steppe MLBA समूहों को दक्षिण एशिया में इस वंश धारा का मुख्य माध्यम बताया।

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मुख्य qpAdm मॉडल में रोड़ वंश संरचना
मॉडल स्रोतहिस्सा
कांस्य युग स्टेपी62.1%
प्राचीन ईरानी कृषक संबंधित17.9%
प्राचीन दक्षिण एशियाई प्रतिनिधि20.0%

17.9 + 62.1 + 20.0 = 100.0। स्रोत: Pathak et al. 2018, Document S1, Table S11.

मजबूती की जांच

संदर्भ बदलें, मजबूत संकेत बना रहता है

अलग प्राचीन स्रोत अलग सवाल पूछते हैं, इसलिए प्रतिशत 43.6 से 62.1 तक बदलता है। हर स्वीकृत मॉडल में स्टेपी संबंधित हिस्सा बड़ा रहा। समान आकार के Steppe_EMBA और Steppe_MLBA स्रोतों वाली पुनः जांच ने 56.9 प्रतिशत दिया।

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छह स्वीकृत मॉडल विन्यासों में रोड़ स्टेपी संबंधित अनुमान
मॉडलअनुमानमॉडल pतालिका
मुख्य MLBA62.1%0.296S11
EMBA + MLBA57.5%0.951S13
समान स्रोत पुनः जांच56.9%0.942S17
केवल EMBA54.4%0.863S12
सिंधु निकट मॉडल47.3%0.642S15
नमाज़गा निकट मॉडल43.6%0.110S14
43.6–62.1%सभी प्रकाशित स्वीकृत मॉडल
56.9%समान आकार के प्राचीन स्रोतों की पुनः जांच
6प्रकाशित मॉडल विन्यासों की तुलना

स्रोत: Pathak et al. 2018, Document S1, Tables S11 से S17.

उसी डेटा पर दूसरी औपचारिक जांच

स्टेपी संदर्भों ने सबसे मजबूत दो संकेत दिए

अध्ययन ने हर उत्तरी या पश्चिमी संदर्भ को पनिया के साथ जोड़कर रोड़ लक्ष्य पर admixture f3 जांच की। अधिक ऋणात्मक Z का अर्थ दोनों तरफ से जुड़े वंश के मिश्रण का मजबूत प्रमाण है। Steppe_MLBA और Steppe_EMBA सबसे आगे रहे।

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पनिया के साथ रोड़ के चुने गए admixture f3 Z स्कोर
संदर्भZ स्कोर
Steppe_MLBA-24.165
Steppe_EMBA-23.768
Anatolia_N-14.353
BMAC-10.269
EHG-9.045
CHG-7.279
R=.91

IBD

11 यूरोपीय समूहों में अधिक स्टेपी वंश के साथ रोड़ से अधिक साझा DNA segments मिले। p = 0.00012।

p<.01

CHROMOPAINTER

रोड़ को अन्य अध्ययन किए गए उत्तर पश्चिम भारतीय समूहों से अधिक यूरोपीय chromosome chunks मिले।

सबसे निकट

प्राचीन स्वात

अध्ययन में रोड़ प्रागैतिहासिक और आरंभिक ऐतिहासिक स्वात नमूनों के सबसे निकट आधुनिक समूह था।

सबसे कम

RoH

तुलना में रोड़ की औसत runs of homozygosity संख्या सबसे कम थी।

ग्राफ में चुने गए प्राचीन संदर्भ और पनिया की जोड़ी है। स्रोत: Pathak et al. 2018, Document S1, Table S6 और लेख के परिणाम.

आनुवंशिक पड़ोस

पठान और सिंधी रोड़ के सबसे निकट रहे

FST allele frequencies का अंतर मापता है। इस ग्राफ में छोटी संख्या का अर्थ कम अंतर है। पठान 0.003510 पर सबसे निकट, सिंधी 0.003955 पर दूसरे और ब्राह्मण 0.005203 पर तीसरे रहे।

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रोड़ से निकटतम 8 आबादियों की FST दूरी
समूहFST
पठान0.003510
सिंधी0.003955
ब्राह्मण0.005203
खत्री0.005594
पश्तून0.005672
ताजिक0.005760
क्षत्रिय0.006191
गुज्जर0.006442

FST साझा वंश का प्रतिशत नहीं है। स्रोत: Pathak et al. 2018, Document S1, Table S5.

समय की गहराई

मिश्रण संकेत औपनिवेशिक काल से सदियों पुराना है

उसी रोड़ लक्ष्य पर 11 संदर्भ जोड़ी runs के point estimates नमूना लिए जाने से 1,204 से 1,893 वर्ष पहले तक रहे। लेख ने इसे लगभग 50 पीढ़ी या 1,500 वर्ष बताया और औपनिवेशिक काल के बड़े योगदान के विरुद्ध तर्क दिया। ये अलग घटनाएं नहीं हैं।

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रोड़ लक्ष्य पर 11 संदर्भ जोड़ी runs के ALDER समय अनुमान
संदर्भ जोड़ीप्रतिनिधि समूहनमूने से वर्ष पहलेमानक त्रुटि
असुर + फ्रांसीसीFrench1310.4±257.7
कोल + फ्रांसीसीFrench1460.7±222.6
हो + फ्रांसीसीFrench1401.6±223.2
थारू + फ्रांसीसीFrench1270.8±228.6
संथाल + फ्रांसीसीFrench1625.1±282.9
गोंड + फ्रांसीसीFrench1786.8±300.6
कोल + जर्मनGerman1491.0±255.0
हो + जर्मनGerman1471.8±254.1
थारू + जर्मनGerman1203.6±230.1
संथाल + जर्मनGerman1628.1±342.0
गोंड + जर्मनGerman1892.7±293.7

30 वर्ष प्रति पीढ़ी के लेख के नियम पर आधारित। Error bars ±1 SE हैं। स्रोत: Pathak et al. 2018, Document S1, Table S18.

लक्षणों से जुड़े आंकड़े

लैक्टेस एलील और मापा गया पिग्मेंटेशन

यहां एलील आवृत्तियां, एक अनुमानित digestion phenotype और मापा गया melanin index है। ये 2018 के वंश मॉडल से अलग प्राथमिक अध्ययनों से आते हैं।

लैक्टेस पर्सिस्टेंस एलील

भारत के नमूने में रोड़ शिखर पर

2012 के 2,284 व्यक्ति और 106 आबादी वाले अध्ययन में पर्याप्त आकार वाले 81 समूहों में रोड़ का -13910*T एलील सबसे अधिक था। लेख ने इसे पुरानी दुग्ध और पशुपालन परंपरा से जोड़ा।

48.9%एलील आवृत्ति, n = 4673.9%अनुमानित वयस्क पाचन फेनोटाइप
Gallego Romero et al. 2012 ↗
पिग्मेंटेशन से जुड़ा variant

SLC24A5 का A एलील 94.3 प्रतिशत

2013 के अध्ययन में genotyped रोड़ cohort में rs1426654-A एलील 94.3 प्रतिशत था। यह variant दक्षिण एशिया में हल्के पिग्मेंटेशन से जुड़ा है और pigmentation variation तथा जन इतिहास के अध्ययन में उपयोगी है।

औसत melanin index41.7

रोड़ pigmentation cohort, n = 56। Cohort B का कुल औसत 45.7 था और उसमें रोड़ भी शामिल थे। यह वर्णनात्मक तुलना है, अलग control group नहीं।

Mallick et al. 2013 ↗

कद और शारीरिक संदर्भ

हरियाणा के नमूने लगातार लंबे कद का संदर्भ दिखाते हैं

रोड़ का अलग औसत कद मापने वाला peer-reviewed अध्ययन नहीं मिला। इसलिए यहां सही दावा क्षेत्र का है। 2006 की छह क्षेत्रीय नमूना तुलना में हरियाणा पहले स्थान पर था। 2023 के पांच जिलों के 200 पुरुष किसानों का औसत कद 171.83 सेंटीमीटर था।

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छह भारतीय क्षेत्रीय नमूनों में औसत कद
क्षेत्रऔसत कदनमूना
हरियाणा167.72 cmn = 100
उत्तर पूर्व164.87 cmn = 280
दक्षिण164.60 cmn = 128
पश्चिम162.10 cmn = 40
मध्य162.00 cmn = 39
पूर्व160.70 cmn = 134
171.83 cm2023 में 200 हरियाणा पुरुष किसान, पांच जिले
45.6 kgउसी अध्ययन में औसत dominant hand grip
4,405हरियाणा के स्कूली बच्चे, हर आयु में ICMR मानक से लंबे

क्षेत्रीय ग्राफ: National Productivity Council, 2006। किसान अध्ययन: Kharb et al. 2023। बच्चों का अध्ययन: Bhasin et al. 1990। नमूने अलग समय और चयन विधियों से हैं, इसलिए उन्हें एक संयुक्त औसत नहीं माना गया।

मातृ और पितृ रेखाएं

पूरा जीनोम एक रेखा से बड़ा है

mtDNA केवल एक मातृ रेखा और Y-DNA केवल एक पितृ रेखा को दिखाता है। वे 62.1 प्रतिशत ऑटोसोमल मॉडल में जोड़े जाने वाले हिस्से नहीं हैं। फिर भी वे रोड़ जन इतिहास की अलग परतें दिखाते हैं।

mtDNAn = 96
58.3% दक्षिण एशियाई37.5% पश्चिम यूरेशियाई3.1% पूर्व और दक्षिण पूर्व एशियाई1.0% मध्य एशियाई
Y-DNAn = 139
35% R1a129% L13% J28% H8% R26% C1% Q

स्रोत: Pathak et al. 2018, Document S1, Tables S3 और S4.

एक मिनट की शब्दावली

साक्ष्य के पीछे पांच मुख्य शब्द

qpAdm

जांचता है कि चुने गए प्राचीन संदर्भों का कौन सा मिश्रण लक्ष्य के allele sharing pattern को दोहरा सकता है।

IBD

साझा पूर्वज से मिले लंबे DNA segments। अधिक और लंबे segments हाल की साझा वंशावली का संकेत दे सकते हैं।

FST

दो नमूनों की allele frequencies का अंतर। छोटी संख्या का अर्थ इस माप पर कम अंतर है।

ANI

उत्तर भारतीय जन निर्माण के लिए बनाया गया सांख्यिकीय वंश profile। यह किसी एक जाति या प्राचीन जनजाति का नाम नहीं है।

स्वात नमूने

आज के उत्तरी पाकिस्तान से प्रागैतिहासिक और ऐतिहासिक DNA, जहां सिंधु संबंधित और स्टेपी संबंधित वंश साथ दिखाई देते हैं।

प्राथमिक अध्ययन

हर संख्या का मूल स्रोत

2018 · AJHG

Pathak et al.

रोड़ genome-wide वंश, IBD, FST, qpAdm, mtDNA, Y-DNA और ALDER.

↗
2019 · Science

Narasimhan et al.

दक्षिण एशिया में Steppe_MLBA प्रवास और ANI निर्माण का प्राचीन DNA ढांचा.

↗
2012 · MBE

Gallego Romero et al.

भारत में lactase persistence, रोड़ शिखर और दुग्ध संस्कृति से संबंध.

↗
2013 · PLOS Genetics

Mallick et al.

रोड़ SLC24A5 आवृत्ति, मापा गया melanin index और दक्षिण एशियाई pigmentation.

↗
NCBI · GSE119653

मूल genotype dataset

2018 अध्ययन के 45 नए उत्तर पश्चिम भारतीय genome-wide samples का सार्वजनिक रिकॉर्ड.

↗
2006 · Productivity

भारतीय क्षेत्रीय कद

छह क्षेत्रीय नमूनों की तुलना में हरियाणा का औसत कद सबसे अधिक।

↗
2023 · Springer

हरियाणा पुरुष किसान

पांच जिलों में 200 किसानों का कद, वजन और दोनों हाथों की grip strength.

↗
1990 · Indian Pediatrics

हरियाणा बाल विकास

4,405 बच्चों का कद और वजन हर आयु में ICMR मानक से अधिक था।

↗

यह साक्ष्य बहु व्यक्ति स्टेपी तुलना और lactase persistence एलील survey में रोड़ की स्पष्ट बढ़त के साथ वास्तविक ऐतिहासिक महत्ता दिखाता है। यह बुद्धि, ताकत, स्वास्थ्य या मानव मूल्य की जैविक रैंकिंग नहीं बनाता।